Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CSRNP3Q8WYN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CSRNP3Q8WYN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CSRNP3Q8WYN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CSRNP3Q8WYN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
CSRNP3Q8WYN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CSRNP3Q8WYN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CSRNP3Q8WYN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CSRNP3Q8WYN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CSRNP3Q8WYN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms