Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLHC1Q8NHS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLHC1Q8NHS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLHC1Q8NHS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLHC1Q8NHS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLHC1Q8NHS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLHC1Q8NHS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLHC1Q8NHS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLHC1Q8NHS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLHC1Q8NHS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLHC1Q8NHS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLHC1Q8NHS4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLHC1Q8NHS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLHC1Q8NHS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLHC1Q8NHS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms