Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPATA4Q8NEY3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA4Q8NEY3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA4Q8NEY3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPATA4Q8NEY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPATA4Q8NEY3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA4Q8NEY3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms