Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFTPA2Q8IWL1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFTPA2Q8IWL1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFTPA2Q8IWL1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFTPA2Q8IWL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SFTPA2Q8IWL1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFTPA2Q8IWL1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFTPA2Q8IWL1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFTPA2Q8IWL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SFTPA2Q8IWL1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFTPA2Q8IWL1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms