Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM46CQ5VWP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM46CQ5VWP2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM46CQ5VWP2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM46CQ5VWP2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM46CQ5VWP2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46CQ5VWP2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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