Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.047e-12■■■■■ 50.1
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TARDBPQ13148 MTRR-219ENST00000511461 3076 ntTSL 55.4□□□□□ -1.547e-12■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.637e-12■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 49.9
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TARDBPQ13148 MTHFR-212ENST00000641446 2820 nt12.91□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 49.8
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TARDBPQ13148 MTHFR-215ENST00000641759 2454 nt12□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 49.8
TARDBPQ13148 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 49.8
TARDBPQ13148 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt11.31□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 49.8
TARDBPQ13148 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 49.8
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TARDBPQ13148 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-14■■■■■ 49.7
TARDBPQ13148 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.642e-14■■■■■ 49.7
TARDBPQ13148 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 49.7
TARDBPQ13148 NAA15-205ENST00000482087 550 ntTSL 419.16■□□□□ 0.669e-14■■■■■ 49.7
TARDBPQ13148 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.299e-14■■■■■ 49.7
TARDBPQ13148 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.399e-14■■■■■ 49.7
TARDBPQ13148 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 49.6
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TARDBPQ13148 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 49.6
TARDBPQ13148 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 49.6
TARDBPQ13148 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.172e-33■■■■■ 49.4
TARDBPQ13148 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 49.4
TARDBPQ13148 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.41□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 49.4
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TARDBPQ13148 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 49.1
TARDBPQ13148 CR1L-204ENST00000530905 930 ntTSL 520.82■□□□□ 0.926e-16■■■■■ 49
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TARDBPQ13148 POLE-220ENST00000544692 2221 ntTSL 520.01■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 49
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TARDBPQ13148 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-14■■■■■ 49
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TARDBPQ13148 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.721e-16■■■■■ 49
TARDBPQ13148 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.923e-22■■■■■ 48.9
TARDBPQ13148 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.93e-22■■■■■ 48.9
TARDBPQ13148 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 212.8□□□□□ -0.363e-22■■■■■ 48.9
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TARDBPQ13148 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 48.9
TARDBPQ13148 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 511.01□□□□□ -0.659e-8■■■■■ 48.9
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TARDBPQ13148 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.819e-14■■■■■ 48.5
TARDBPQ13148 PPP2R5C-223ENST00000556805 558 ntTSL 47.78□□□□□ -1.169e-12■■■■■ 48.1
TARDBPQ13148 PIP5K1C-207ENST00000636612 153 ntTSL 54.3□□□□□ -1.728e-16■■■■■ 48.1
TARDBPQ13148 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 422.77■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 47.7
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TARDBPQ13148 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 420.9■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 47.7
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TARDBPQ13148 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 47.7
TARDBPQ13148 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 419.14■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 47.7
TARDBPQ13148 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.367e-7■■■■■ 47.7
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TARDBPQ13148 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 47.7
TARDBPQ13148 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 47.7
TARDBPQ13148 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-14■■■■■ 47.7
TARDBPQ13148 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 314.78□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 214.67□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 513.63□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 47.5
TARDBPQ13148 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 47.4
TARDBPQ13148 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 47.4
TARDBPQ13148 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 523.61■■□□□ 1.376e-8■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 521.91■■□□□ 1.16e-8■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 47.2
TARDBPQ13148 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 417.21■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 47.2
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