Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 PET8YNL003C 855 nt8.96□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 OYE3YPL171C 1203 nt8.96□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 FIT1YDR534C 1587 nt8.95□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 CAB5YDR196C 726 nt8.95□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 UTP6YDR449C 1323 nt8.95□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 LSB6YJL100W 1824 nt8.94□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 YPL071CYPL071C 471 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 RSC8YFR037C 1674 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 LOT5YKL183W 921 nt8.92□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 ZAP1YJL056C 2643 nt8.92□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 SMM1YNR015W 1155 nt8.91□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 HMT1YBR034C 1047 nt8.91□□□□□ -0.98
YLL054CQ12244 MET30YIL046W 1923 nt8.9□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 SEC61YLR378C 1443 nt8.89□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 PRY1YJL079C 900 nt8.89□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 GNP1YDR508C 1992 nt8.87□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 BNS1YGR230W 414 nt8.87□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 SEM1YDR363W-A 270 nt8.86□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 OXA1YER154W 1209 nt8.86□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 Q0144Q0144 330 nt8.86□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 YPI1YFR003C 468 nt8.85□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 NUC1YJL208C 990 nt8.85□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 YNL190WYNL190W 615 nt8.85□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.85□□□□□ -0.99
YLL054CQ12244 BNI5YNL166C 1347 nt8.83□□□□□ -1
YLL054CQ12244 PHO23YNL097C 993 nt8.83□□□□□ -1
YLL054CQ12244 YRF1-2YER190W 5046 nt8.83□□□□□ -1
YLL054CQ12244 NDE1YMR145C 1683 nt8.82□□□□□ -1
YLL054CQ12244 QDR2YIL121W 1629 nt8.81□□□□□ -1
YLL054CQ12244 CSM1YCR086W 573 nt8.81□□□□□ -1
YLL054CQ12244 SPP2YOR148C 558 nt8.81□□□□□ -1
YLL054CQ12244 ODC1YPL134C 933 nt8.81□□□□□ -1
YLL054CQ12244 MSC1YML128C 1542 nt8.8□□□□□ -1
YLL054CQ12244 LAS17YOR181W 1902 nt8.8□□□□□ -1
YLL054CQ12244 YER188WYER188W 720 nt8.8□□□□□ -1
YLL054CQ12244 REC114YMR133W 1287 nt8.8□□□□□ -1
YLL054CQ12244 ACH1YBL015W 1581 nt8.8□□□□□ -1
YLL054CQ12244 VRG4YGL225W 1014 nt8.79□□□□□ -1
YLL054CQ12244 PET20YPL159C 762 nt8.79□□□□□ -1
YLL054CQ12244 PUS5YLR165C 765 nt8.78□□□□□ -1
YLL054CQ12244 FMS1YMR020W 1527 nt8.78□□□□□ -1
YLL054CQ12244 DLD2YDL178W 1593 nt8.78□□□□□ -1
YLL054CQ12244 FRT1YOR324C 1809 nt8.77□□□□□ -1
YLL054CQ12244 PMA2YPL036W 2844 nt8.77□□□□□ -1
YLL054CQ12244 YPS3YLR121C 1527 nt8.77□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 FLR1YBR008C 1647 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 HXT12YIL170W 1374 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 GID8YMR135C 1368 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 VPS62YGR141W 1404 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 RAS2YNL098C 969 nt8.75□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 RPT5YOR117W 1305 nt8.75□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 CCR4YAL021C 2514 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 FUB1YCR076C 753 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 YDR509WYDR509W 348 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 ATG17YLR423C 1254 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 MRS6YOR370C 1812 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 SSL2YIL143C 2532 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 MAS1YLR163C 1389 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 YJL055WYJL055W 738 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 YNR029CYNR029C 1290 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 ADH1YOL086C 1047 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 OSH7YHR001W 1314 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 RIB2YOL066C 1776 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 DIG1YPL049C 1359 nt8.72□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 BEM1YBR200W 1656 nt8.72□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 NBA1YOL070C 1506 nt8.71□□□□□ -1.01
YLL054CQ12244 YDL086WYDL086W 822 nt8.71□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 KDX1YKL161C 1302 nt8.71□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 FAF1YIL019W 1041 nt8.7□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 SKG1YKR100C 1068 nt8.7□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 RIB7YBR153W 735 nt8.7□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 YKL133CYKL133C 1392 nt8.7□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 snR78snR78 87 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 YEL023CYEL023C 2049 nt8.68□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 OYE2YHR179W 1203 nt8.68□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 HXT10YFL011W 1641 nt8.68□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 YJL195CYJL195C 702 nt8.67□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 SAM3YPL274W 1764 nt8.66□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 MIM1YOL026C 342 nt8.66□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 HEM13YDR044W 987 nt8.65□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 FHN1YGR131W 525 nt8.65□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 MDM35YKL053C-A 261 nt8.65□□□□□ -1.02
YLL054CQ12244 YHR219WYHR219W 1875 nt8.64□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 CTF3YLR381W 2202 nt8.64□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 TPS1YBR126C 1488 nt8.64□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 EAF3YPR023C 1206 nt8.63□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 GAL3YDR009W 1563 nt8.62□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 SOL2YCR073W-A 948 nt8.62□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 GGC1YDL198C 903 nt8.62□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 NAS6YGR232W 687 nt8.61□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 SWP1YMR149W 861 nt8.61□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 DUS3YLR401C 2007 nt8.6□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 FUN14YAL008W 597 nt8.6□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 GPN2YOR262W 1044 nt8.6□□□□□ -1.03
YLL054CQ12244 THP3YPR045C 1413 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL054CQ12244 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.58□□□□□ -1.04
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