Protein–RNA interactions for Protein: Q12177

YLL056C, Uncharacterized protein YLL056C, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CQ12177 MRS6YOR370C 1812 nt8.98□□□□□ -0.97
YLL056CQ12177 YGL114WYGL114W 2178 nt8.98□□□□□ -0.97
YLL056CQ12177 SPS100YHR139C 981 nt8.97□□□□□ -0.97
YLL056CQ12177 YHR219WYHR219W 1875 nt8.96□□□□□ -0.97
YLL056CQ12177 ITR2YOL103W 1830 nt8.96□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 PAU15YIR041W 375 nt8.94□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 YNR064CYNR064C 873 nt8.94□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 TVP23YDR084C 600 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 POT1YIL160C 1254 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 OPI3YJR073C 621 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 LSR1LSR1 1175 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 YMR262WYMR262W 942 nt8.91□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 VMA11YPL234C 495 nt8.91□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 TIP1YBR067C 633 nt8.91□□□□□ -0.98
YLL056CQ12177 RPD3YNL330C 1302 nt8.89□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 ELO1YJL196C 933 nt8.89□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 ABZ2YMR289W 1125 nt8.89□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 ODC1YPL134C 933 nt8.87□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 SSL2YIL143C 2532 nt8.87□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 GSF2YML048W 1212 nt8.86□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 YMR209CYMR209C 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 CWP2YKL096W-A 279 nt8.85□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 KEL3YPL263C 1956 nt8.84□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 YMR265CYMR265C 1386 nt8.84□□□□□ -0.99
YLL056CQ12177 ENO2YHR174W 1314 nt8.83□□□□□ -1
YLL056CQ12177 TUB4YLR212C 1422 nt8.83□□□□□ -1
YLL056CQ12177 PAU5YFL020C 369 nt8.83□□□□□ -1
YLL056CQ12177 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.82□□□□□ -1
YLL056CQ12177 TIM44YIL022W 1296 nt8.82□□□□□ -1
YLL056CQ12177 APS2YJR058C 444 nt8.82□□□□□ -1
YLL056CQ12177 SNX3YOR357C 489 nt8.82□□□□□ -1
YLL056CQ12177 HAP5YOR358W 729 nt8.82□□□□□ -1
YLL056CQ12177 NIF3YGL221C 867 nt8.81□□□□□ -1
YLL056CQ12177 PCP1YGR101W 1041 nt8.81□□□□□ -1
YLL056CQ12177 AMF1YOR378W 1548 nt8.8□□□□□ -1
YLL056CQ12177 SUV3YPL029W 2214 nt8.8□□□□□ -1
YLL056CQ12177 RPN14YGL004C 1254 nt8.8□□□□□ -1
YLL056CQ12177 ESS1YJR017C 513 nt8.79□□□□□ -1
YLL056CQ12177 SWT21YNL187W 1074 nt8.79□□□□□ -1
YLL056CQ12177 PGC1YPL206C 966 nt8.79□□□□□ -1
YLL056CQ12177 snR31snR31 225 nt8.78□□□□□ -1
YLL056CQ12177 SFL1YOR140W 2301 nt8.77□□□□□ -1
YLL056CQ12177 STP3YLR375W 1032 nt8.77□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 KRR1YCL059C 951 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 MDM35YKL053C-A 261 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 RPC31YNL151C 756 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 DMA2YNL116W 1569 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 TPC1YGR096W 945 nt8.75□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 KRE1YNL322C 942 nt8.75□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 HEL2YDR266C 1920 nt8.75□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 MET1YKR069W 1782 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 CRC1YOR100C 984 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 PAR32YDL173W 888 nt8.73□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 YBR232CYBR232C 360 nt8.72□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 LEU2YCL018W 1095 nt8.72□□□□□ -1.01
YLL056CQ12177 SPE2YOL052C 1191 nt8.71□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 RIM2YBR192W 1134 nt8.71□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 PSD1YNL169C 1503 nt8.7□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 NAS2YIL007C 663 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 YKL053WYKL053W 375 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 DPL1YDR294C 1770 nt8.68□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 THP3YPR045C 1413 nt8.68□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 NAM8YHR086W 1572 nt8.68□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 CYT1YOR065W 930 nt8.67□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 CDD1YLR245C 429 nt8.66□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 IGD1YFR017C 588 nt8.65□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 FSH2YMR222C 672 nt8.65□□□□□ -1.02
YLL056CQ12177 KGD2YDR148C 1392 nt8.64□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 HXT10YFL011W 1641 nt8.63□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 REX2YLR059C 810 nt8.63□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 SAN1YDR143C 1833 nt8.63□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 YHR218WYHR218W 1812 nt8.63□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 SRP54YPR088C 1626 nt8.62□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 SEN2YLR105C 1134 nt8.62□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 YRF1-2YER190W 5046 nt8.61□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 LEU4YNL104C 1860 nt8.61□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 YKR012CYKR012C 378 nt8.6□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 YDR467CYDR467C 327 nt8.59□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 SBP1YHL034C 885 nt8.59□□□□□ -1.03
YLL056CQ12177 MAE1YKL029C 2010 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 INH1YDL181W 258 nt8.58□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 ADH3YMR083W 1128 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 AGP3YFL055W 1677 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 PHB2YGR231C 933 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 YJL064WYJL064W 396 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 GPM1YKL152C 744 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 SDS24YBR214W 1584 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 GGA2YHR108W 1758 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 YPT11YNL304W 1254 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms