Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 KRR1YCL059C 951 nt9.03□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 YJL055WYJL055W 738 nt9.03□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 YHR218WYHR218W 1812 nt9.03□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 YPI1YFR003C 468 nt9.02□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 LSR1LSR1 1175 nt9.02□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 VMA11YPL234C 495 nt9.02□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 URA8YJR103W 1737 nt9.02□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 ERG13YML126C 1476 nt9.01□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 YHL008CYHL008C 1884 nt9□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 Q0010Q0010 387 nt9□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 ITR2YOL103W 1830 nt9□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 TMA23YMR269W 636 nt8.99□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 RRT8YOL048C 1029 nt8.99□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 DDI1YER143W 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 YMR262WYMR262W 942 nt8.98□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 TIP1YBR067C 633 nt8.98□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 GAL3YDR009W 1563 nt8.98□□□□□ -0.97
VHS3Q08438 IMO32YGR031W 1029 nt8.95□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 RIB2YOL066C 1776 nt8.94□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 HXT10YFL011W 1641 nt8.94□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 SAC7YDR389W 1965 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 RBG2YGR173W 1107 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 RPC31YNL151C 756 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 SNX3YOR357C 489 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 YJR154WYJR154W 1041 nt8.92□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 DTR1YBR180W 1719 nt8.91□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 HXK1YFR053C 1458 nt8.91□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 RIM2YBR192W 1134 nt8.91□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 GTB1YDR221W 2109 nt8.9□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 GAL2YLR081W 1725 nt8.9□□□□□ -0.98
VHS3Q08438 YJR114WYJR114W 393 nt8.89□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YNR029CYNR029C 1290 nt8.89□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 INH1YDL181W 258 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 ADE8YDR408C 645 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 RPN14YGL004C 1254 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YNR064CYNR064C 873 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YMR265CYMR265C 1386 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 AGP3YFL055W 1677 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 THI72YOR192C 1800 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 DAK2YFL053W 1776 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 ALD5YER073W 1563 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 YIL177CYIL177C 5277 nt8.85□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 DPL1YDR294C 1770 nt8.84□□□□□ -0.99
VHS3Q08438 KEL3YPL263C 1956 nt8.83□□□□□ -1
VHS3Q08438 ELO1YJL196C 933 nt8.83□□□□□ -1
VHS3Q08438 ADH1YOL086C 1047 nt8.83□□□□□ -1
VHS3Q08438 HAP5YOR358W 729 nt8.83□□□□□ -1
VHS3Q08438 RSC4YKR008W 1878 nt8.82□□□□□ -1
VHS3Q08438 YDR306CYDR306C 1437 nt8.81□□□□□ -1
VHS3Q08438 snR31snR31 225 nt8.8□□□□□ -1
VHS3Q08438 TVP23YDR084C 600 nt8.79□□□□□ -1
VHS3Q08438 OPI3YJR073C 621 nt8.79□□□□□ -1
VHS3Q08438 HEM14YER014W 1620 nt8.79□□□□□ -1
VHS3Q08438 NBA1YOL070C 1506 nt8.79□□□□□ -1
VHS3Q08438 LEU4YNL104C 1860 nt8.79□□□□□ -1
VHS3Q08438 SUV3YPL029W 2214 nt8.78□□□□□ -1
VHS3Q08438 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.78□□□□□ -1
VHS3Q08438 PCP1YGR101W 1041 nt8.78□□□□□ -1
VHS3Q08438 YPR126CYPR126C 309 nt8.78□□□□□ -1
VHS3Q08438 CSM2YIL132C 642 nt8.77□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 IML3YBR107C 738 nt8.77□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 PUS7YOR243C 2031 nt8.75□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 SPS100YHR139C 981 nt8.75□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 CCT5YJR064W 1689 nt8.75□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 SNZ1YMR096W 894 nt8.74□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 RFC1YOR217W 2586 nt8.73□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 YDR467CYDR467C 327 nt8.73□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 YOR072WYOR072W 315 nt8.73□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 TOK1YJL093C 2076 nt8.71□□□□□ -1.01
VHS3Q08438 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.71□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.71□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 SWT21YNL187W 1074 nt8.71□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 CRC1YOR100C 984 nt8.71□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 SFL1YOR140W 2301 nt8.69□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 NPP2YEL016C 1482 nt8.69□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 CTI6YPL181W 1521 nt8.69□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 YJL195CYJL195C 702 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 MET1YKR069W 1782 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 ABZ2YMR289W 1125 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 AMF1YOR378W 1548 nt8.66□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 GPM1YKL152C 744 nt8.65□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 MHF1YOL086W-A 273 nt8.65□□□□□ -1.02
VHS3Q08438 ENO2YHR174W 1314 nt8.64□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 YBL095WYBL095W 813 nt8.64□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 KGD2YDR148C 1392 nt8.62□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 GGA2YHR108W 1758 nt8.61□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 FET5YFL041W 1869 nt8.6□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 TAF13YML098W 504 nt8.6□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.59□□□□□ -1.03
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