Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 YKL133CYKL133C 1392 nt9.22□□□□□ -0.93
UFO1Q04511 SFP1YLR403W 2052 nt9.2□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 MET2YNL277W 1461 nt9.2□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 ITR2YOL103W 1830 nt9.19□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 ADE8YDR408C 645 nt9.18□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 LSR1LSR1 1175 nt9.18□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.17□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 THI72YOR192C 1800 nt9.16□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 YMR209CYMR209C 1374 nt9.15□□□□□ -0.94
UFO1Q04511 SSL2YIL143C 2532 nt9.14□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 ADH7YCR105W 1086 nt9.13□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 YJR114WYJR114W 393 nt9.13□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 ODC1YPL134C 933 nt9.13□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 CTI6YPL181W 1521 nt9.13□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 OPI3YJR073C 621 nt9.12□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 PAU15YIR041W 375 nt9.11□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 DTR1YBR180W 1719 nt9.11□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 YNR064CYNR064C 873 nt9.1□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 IML3YBR107C 738 nt9.1□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 SPS100YHR139C 981 nt9.09□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 ELO1YJL196C 933 nt9.09□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 VMA11YPL234C 495 nt9.09□□□□□ -0.95
UFO1Q04511 CPD1YGR247W 720 nt9.08□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 RPD3YNL330C 1302 nt9.07□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 TVP23YDR084C 600 nt9.07□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 MHF1YOL086W-A 273 nt9.07□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 TIP1YBR067C 633 nt9.07□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 ILV2YMR108W 2064 nt9.07□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 ESS1YJR017C 513 nt9.06□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 CWP2YKL096W-A 279 nt9.06□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 TAF13YML098W 504 nt9.05□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 GTB1YDR221W 2109 nt9.04□□□□□ -0.96
UFO1Q04511 YMR265CYMR265C 1386 nt9.02□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 ABZ2YMR289W 1125 nt9.02□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 TIM44YIL022W 1296 nt9.01□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 POT1YIL160C 1254 nt9.01□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 YMR262WYMR262W 942 nt9.01□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 DMA2YNL116W 1569 nt9.01□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 SNX3YOR357C 489 nt9.01□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 SUV3YPL029W 2214 nt9.01□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 HAP5YOR358W 729 nt9□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 SFL1YOR140W 2301 nt8.99□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 KEL3YPL263C 1956 nt8.99□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 MDM35YKL053C-A 261 nt8.98□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 SWT21YNL187W 1074 nt8.98□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 APS2YJR058C 444 nt8.97□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 RPC31YNL151C 756 nt8.97□□□□□ -0.97
UFO1Q04511 PGC1YPL206C 966 nt8.96□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 NIF3YGL221C 867 nt8.95□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 AMF1YOR378W 1548 nt8.95□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 PCP1YGR101W 1041 nt8.94□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 CRC1YOR100C 984 nt8.94□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 PSD1YNL169C 1503 nt8.94□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 DPL1YDR294C 1770 nt8.94□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 MET1YKR069W 1782 nt8.94□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 HMG2YLR450W 3138 nt8.93□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 RIM2YBR192W 1134 nt8.93□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 YBR232CYBR232C 360 nt8.93□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 ENO2YHR174W 1314 nt8.93□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 TUB4YLR212C 1422 nt8.93□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 YHR218WYHR218W 1812 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 RPN14YGL004C 1254 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 YGR139WYGR139W 339 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 GSF2YML048W 1212 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 TOK1YJL093C 2076 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 MAE1YKL029C 2010 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 HEM14YER014W 1620 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 HXT10YFL011W 1641 nt8.91□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 TPC1YGR096W 945 nt8.9□□□□□ -0.98
UFO1Q04511 KRR1YCL059C 951 nt8.89□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 PAU5YFL020C 369 nt8.89□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 snR31snR31 225 nt8.89□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 YKL053WYKL053W 375 nt8.88□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 NAS2YIL007C 663 nt8.86□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 CYT1YOR065W 930 nt8.86□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 MCM5YLR274W 2328 nt8.85□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 CDD1YLR245C 429 nt8.85□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 STP3YLR375W 1032 nt8.85□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 PUP1YOR157C 786 nt8.85□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 TPO4YOR273C 1980 nt8.84□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 LEU4YNL104C 1860 nt8.84□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 KGD2YDR148C 1392 nt8.84□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 ACO2YJL200C 2370 nt8.84□□□□□ -0.99
UFO1Q04511 SEN2YLR105C 1134 nt8.83□□□□□ -1
UFO1Q04511 SPE2YOL052C 1191 nt8.83□□□□□ -1
UFO1Q04511 NAM8YHR086W 1572 nt8.82□□□□□ -1
UFO1Q04511 LEU2YCL018W 1095 nt8.82□□□□□ -1
UFO1Q04511 AGP3YFL055W 1677 nt8.81□□□□□ -1
UFO1Q04511 SAN1YDR143C 1833 nt8.81□□□□□ -1
UFO1Q04511 THP3YPR045C 1413 nt8.8□□□□□ -1
UFO1Q04511 YDR467CYDR467C 327 nt8.79□□□□□ -1
UFO1Q04511 KRE1YNL322C 942 nt8.79□□□□□ -1
UFO1Q04511 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.77□□□□□ -1.01
UFO1Q04511 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.77□□□□□ -1.01
UFO1Q04511 NAP1YKR048C 1254 nt8.77□□□□□ -1.01
UFO1Q04511 SRP54YPR088C 1626 nt8.76□□□□□ -1.01
UFO1Q04511 PAR32YDL173W 888 nt8.76□□□□□ -1.01
UFO1Q04511 YJL064WYJL064W 396 nt8.76□□□□□ -1.01
UFO1Q04511 REX2YLR059C 810 nt8.76□□□□□ -1.01
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