Protein–RNA interactions for Protein: Q02959

HOS3, Histone deacetylase HOS3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOS3Q02959 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 SNX3YOR357C 489 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 THI72YOR192C 1800 nt9.68□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 MIM1YOL026C 342 nt9.67□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 FET5YFL041W 1869 nt9.67□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 NUC1YJL208C 990 nt9.66□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 YRF1-2YER190W 5046 nt9.65□□□□□ -0.86
HOS3Q02959 KRR1YCL059C 951 nt9.64□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 NPP2YEL016C 1482 nt9.62□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 YMR226CYMR226C 804 nt9.61□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 LSM5YER146W 282 nt9.6□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 EAF3YPR023C 1206 nt9.6□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 SAM3YPL274W 1764 nt9.6□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 ERG13YML126C 1476 nt9.59□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 SAC7YDR389W 1965 nt9.59□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 GID7YCL039W 2238 nt9.59□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 HBS1YKR084C 1836 nt9.59□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 RBG1YAL036C 1110 nt9.59□□□□□ -0.87
HOS3Q02959 YGR012WYGR012W 1182 nt9.58□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 PRY1YJL079C 900 nt9.58□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 MTO1YGL236C 2010 nt9.58□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 DAK2YFL053W 1776 nt9.58□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 OYE2YHR179W 1203 nt9.56□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.55□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.55□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 LSB5YCL034W 1065 nt9.55□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 YDR467CYDR467C 327 nt9.54□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 DUR3YHL016C 2208 nt9.54□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 SDH5YOL071W 489 nt9.53□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 GND1YHR183W 1470 nt9.53□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 TRP2YER090W 1524 nt9.52□□□□□ -0.88
HOS3Q02959 DDI1YER143W 1287 nt9.52□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 ELO1YJL196C 933 nt9.51□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 RPT5YOR117W 1305 nt9.51□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 YMR265CYMR265C 1386 nt9.5□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 UFD1YGR048W 1086 nt9.5□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 TPS1YBR126C 1488 nt9.5□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 LOT5YKL183W 921 nt9.49□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 FIT1YDR534C 1587 nt9.49□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 HXT11YOL156W 1704 nt9.48□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 THI6YPL214C 1623 nt9.48□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 SMM1YNR015W 1155 nt9.47□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 ORT1YOR130C 879 nt9.47□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 DUS3YLR401C 2007 nt9.46□□□□□ -0.89
HOS3Q02959 YJL118WYJL118W 660 nt9.46□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 HAP5YOR358W 729 nt9.46□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.46□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 GTB1YDR221W 2109 nt9.46□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 SUV3YPL029W 2214 nt9.44□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 snR4snR4 186 nt9.44□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 BSP1YPR171W 1731 nt9.44□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 TMA23YMR269W 636 nt9.43□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 YNR064CYNR064C 873 nt9.43□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 SRM1YGL097W 1449 nt9.42□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 RPN14YGL004C 1254 nt9.41□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 RRT8YOL048C 1029 nt9.41□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 EMC3YKL207W 762 nt9.4□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 YBL095WYBL095W 813 nt9.4□□□□□ -0.9
HOS3Q02959 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.39□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 YLR111WYLR111W 333 nt9.39□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 REG2YBR050C 1017 nt9.39□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 AAT1YKL106W 1356 nt9.38□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 POP2YNR052C 1302 nt9.38□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 RAD51YER095W 1203 nt9.38□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 YJL055WYJL055W 738 nt9.38□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 GPM1YKL152C 744 nt9.38□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 KEL3YPL263C 1956 nt9.37□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 IMO32YGR031W 1029 nt9.36□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 CRC1YOR100C 984 nt9.36□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 FTH1YBR207W 1398 nt9.35□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 YJR114WYJR114W 393 nt9.34□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 ADE16YLR028C 1776 nt9.34□□□□□ -0.91
HOS3Q02959 SFL1YOR140W 2301 nt9.33□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 LPD1YFL018C 1500 nt9.33□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 ADE8YDR408C 645 nt9.33□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 RAD23YEL037C 1197 nt9.33□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 YNR029CYNR029C 1290 nt9.33□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 CAB5YDR196C 726 nt9.32□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 YMC2YBR104W 990 nt9.32□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 YJR154WYJR154W 1041 nt9.31□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 GAL3YDR009W 1563 nt9.3□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 HXT12YIL170W 1374 nt9.3□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 OPI3YJR073C 621 nt9.3□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 STE4YOR212W 1272 nt9.3□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 RIB7YBR153W 735 nt9.3□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 YLR072WYLR072W 2082 nt9.3□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 THI3YDL080C 1830 nt9.29□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 YMR210WYMR210W 1350 nt9.29□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 VRG4YGL225W 1014 nt9.29□□□□□ -0.92
HOS3Q02959 MET1YKR069W 1782 nt9.27□□□□□ -0.93
HOS3Q02959 RIB3YDR487C 627 nt9.26□□□□□ -0.93
HOS3Q02959 snR31snR31 225 nt9.26□□□□□ -0.93
HOS3Q02959 KGD2YDR148C 1392 nt9.25□□□□□ -0.93
HOS3Q02959 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.1 ms