Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00205P59089 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00205P59089 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00205P59089 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00205P59089 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00205P59089 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00205P59089 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00205P59089 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00205P59089 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00205P59089 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00205P59089 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00205P59089 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00205P59089 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00205P59089 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00205P59089 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00205P59089 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00205P59089 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00205P59089 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00205P59089 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00205P59089 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00205P59089 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00205P59089 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00205P59089 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00205P59089 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00205P59089 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00205P59089 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00205P59089 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms