Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 CWP2YKL096W-A 279 nt7.72□□□□□ -1.17
UFD1P53044 EAF3YPR023C 1206 nt7.72□□□□□ -1.17
UFD1P53044 OYE2YHR179W 1203 nt7.71□□□□□ -1.18
UFD1P53044 PCP1YGR101W 1041 nt7.7□□□□□ -1.18
UFD1P53044 GPN2YOR262W 1044 nt7.7□□□□□ -1.18
UFD1P53044 YJL195CYJL195C 702 nt7.69□□□□□ -1.18
UFD1P53044 ADH1YOL086C 1047 nt7.69□□□□□ -1.18
UFD1P53044 TPS1YBR126C 1488 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 YHR219WYHR219W 1875 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 AIM1YAL046C 357 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 ENT4YLL038C 744 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
UFD1P53044 RIB2YOL066C 1776 nt7.67□□□□□ -1.18
UFD1P53044 YDR455CYDR455C 309 nt7.67□□□□□ -1.18
UFD1P53044 FUN14YAL008W 597 nt7.67□□□□□ -1.18
UFD1P53044 YLR046CYLR046C 813 nt7.66□□□□□ -1.18
UFD1P53044 LSR1LSR1 1175 nt7.66□□□□□ -1.18
UFD1P53044 YNR029CYNR029C 1290 nt7.66□□□□□ -1.18
UFD1P53044 RIB7YBR153W 735 nt7.66□□□□□ -1.18
UFD1P53044 GAL3YDR009W 1563 nt7.66□□□□□ -1.18
UFD1P53044 DLD3YEL071W 1491 nt7.65□□□□□ -1.18
UFD1P53044 HXT10YFL011W 1641 nt7.65□□□□□ -1.18
UFD1P53044 TIM44YIL022W 1296 nt7.65□□□□□ -1.18
UFD1P53044 MEX67YPL169C 1800 nt7.65□□□□□ -1.18
UFD1P53044 LPD1YFL018C 1500 nt7.64□□□□□ -1.19
UFD1P53044 RPD3YNL330C 1302 nt7.64□□□□□ -1.19
UFD1P53044 STE4YOR212W 1272 nt7.64□□□□□ -1.19
UFD1P53044 YLR173WYLR173W 1827 nt7.63□□□□□ -1.19
UFD1P53044 RTG2YGL252C 1767 nt7.63□□□□□ -1.19
UFD1P53044 THI6YPL214C 1623 nt7.63□□□□□ -1.19
UFD1P53044 LSM5YER146W 282 nt7.62□□□□□ -1.19
UFD1P53044 TMA23YMR269W 636 nt7.62□□□□□ -1.19
UFD1P53044 DDI1YER143W 1287 nt7.61□□□□□ -1.19
UFD1P53044 YMR262WYMR262W 942 nt7.61□□□□□ -1.19
UFD1P53044 YEL008WYEL008W 381 nt7.6□□□□□ -1.19
UFD1P53044 ERG13YML126C 1476 nt7.6□□□□□ -1.19
UFD1P53044 KRR1YCL059C 951 nt7.58□□□□□ -1.2
UFD1P53044 RRT8YOL048C 1029 nt7.58□□□□□ -1.2
UFD1P53044 VMA11YPL234C 495 nt7.58□□□□□ -1.2
UFD1P53044 AGP3YFL055W 1677 nt7.57□□□□□ -1.2
UFD1P53044 IMO32YGR031W 1029 nt7.57□□□□□ -1.2
UFD1P53044 UFD1YGR048W 1086 nt7.57□□□□□ -1.2
UFD1P53044 YLR349WYLR349W 507 nt7.57□□□□□ -1.2
UFD1P53044 ITR2YOL103W 1830 nt7.57□□□□□ -1.2
UFD1P53044 SAC7YDR389W 1965 nt7.56□□□□□ -1.2
UFD1P53044 DUR3YHL016C 2208 nt7.56□□□□□ -1.2
UFD1P53044 NBA1YOL070C 1506 nt7.56□□□□□ -1.2
UFD1P53044 TIP1YBR067C 633 nt7.54□□□□□ -1.2
UFD1P53044 DAK2YFL053W 1776 nt7.54□□□□□ -1.2
UFD1P53044 ADH7YCR105W 1086 nt7.53□□□□□ -1.2
UFD1P53044 INH1YDL181W 258 nt7.53□□□□□ -1.2
UFD1P53044 RPC31YNL151C 756 nt7.53□□□□□ -1.2
UFD1P53044 RIM2YBR192W 1134 nt7.53□□□□□ -1.2
UFD1P53044 GCD11YER025W 1584 nt7.53□□□□□ -1.2
UFD1P53044 CPD1YGR247W 720 nt7.51□□□□□ -1.21
UFD1P53044 SNZ1YMR096W 894 nt7.51□□□□□ -1.21
UFD1P53044 SNX3YOR357C 489 nt7.5□□□□□ -1.21
UFD1P53044 YPR126CYPR126C 309 nt7.5□□□□□ -1.21
UFD1P53044 CCT5YJR064W 1689 nt7.5□□□□□ -1.21
UFD1P53044 YIL177CYIL177C 5277 nt7.5□□□□□ -1.21
UFD1P53044 ADE8YDR408C 645 nt7.49□□□□□ -1.21
UFD1P53044 RAD51YER095W 1203 nt7.49□□□□□ -1.21
UFD1P53044 PAU15YIR041W 375 nt7.49□□□□□ -1.21
UFD1P53044 YJR114WYJR114W 393 nt7.48□□□□□ -1.21
UFD1P53044 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.47□□□□□ -1.21
UFD1P53044 YNR064CYNR064C 873 nt7.46□□□□□ -1.22
UFD1P53044 DPL1YDR294C 1770 nt7.46□□□□□ -1.22
UFD1P53044 FIT1YDR534C 1587 nt7.46□□□□□ -1.22
UFD1P53044 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.46□□□□□ -1.22
UFD1P53044 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.46□□□□□ -1.22
UFD1P53044 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.46□□□□□ -1.22
UFD1P53044 ECM10YEL030W 1935 nt7.45□□□□□ -1.22
UFD1P53044 OPI3YJR073C 621 nt7.45□□□□□ -1.22
UFD1P53044 TVP23YDR084C 600 nt7.44□□□□□ -1.22
UFD1P53044 ELO1YJL196C 933 nt7.44□□□□□ -1.22
UFD1P53044 TAF13YML098W 504 nt7.44□□□□□ -1.22
UFD1P53044 YMR265CYMR265C 1386 nt7.44□□□□□ -1.22
UFD1P53044 LEU4YNL104C 1860 nt7.43□□□□□ -1.22
UFD1P53044 IML3YBR107C 738 nt7.43□□□□□ -1.22
UFD1P53044 MET30YIL046W 1923 nt7.42□□□□□ -1.22
UFD1P53044 SPS100YHR139C 981 nt7.42□□□□□ -1.22
UFD1P53044 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.42□□□□□ -1.22
UFD1P53044 KEL3YPL263C 1956 nt7.41□□□□□ -1.22
UFD1P53044 MIM1YOL026C 342 nt7.41□□□□□ -1.22
UFD1P53044 HAP5YOR358W 729 nt7.41□□□□□ -1.22
UFD1P53044 SUV3YPL029W 2214 nt7.41□□□□□ -1.22
UFD1P53044 CTI6YPL181W 1521 nt7.41□□□□□ -1.22
UFD1P53044 MCM5YLR274W 2328 nt7.4□□□□□ -1.22
UFD1P53044 ADE2YOR128C 1716 nt7.4□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89.3 ms