Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 MSF1YPR047W 1410 nt8.46□□□□□ -1.05
SSZ1P38788 FCY21YER060W 1587 nt8.46□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 TAT2YOL020W 1779 nt8.45□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 PAU16YKL224C 372 nt8.45□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 NAT4YMR069W 858 nt8.45□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.45□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 MCM5YLR274W 2328 nt8.45□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 KRR1YCL059C 951 nt8.44□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ECM10YEL030W 1935 nt8.43□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 GPN2YOR262W 1044 nt8.43□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 RIM2YBR192W 1134 nt8.43□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 MET30YIL046W 1923 nt8.42□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 VMA11YPL234C 495 nt8.42□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ITR2YOL103W 1830 nt8.41□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 RPC31YNL151C 756 nt8.41□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 MSB4YOL112W 1479 nt8.4□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 SOL2YCR073W-A 948 nt8.4□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 CSM1YCR086W 573 nt8.4□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.4□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 YNL190WYNL190W 615 nt8.4□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 ARO7YPR060C 771 nt8.4□□□□□ -1.06
SSZ1P38788 NUC1YJL208C 990 nt8.39□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 RAS2YNL098C 969 nt8.38□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 INH1YDL181W 258 nt8.37□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 NAS6YGR232W 687 nt8.37□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 YDR306CYDR306C 1437 nt8.37□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 PUS7YOR243C 2031 nt8.36□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 DPL1YDR294C 1770 nt8.36□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 SDH5YOL071W 489 nt8.36□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 YPL041CYPL041C 624 nt8.36□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 YGR012WYGR012W 1182 nt8.35□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 LAS17YOR181W 1902 nt8.35□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 YDR455CYDR455C 309 nt8.34□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 FET5YFL041W 1869 nt8.34□□□□□ -1.07
SSZ1P38788 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 SNX3YOR357C 489 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 TIP1YBR067C 633 nt8.33□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 MIM1YOL026C 342 nt8.32□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 ADE2YOR128C 1716 nt8.32□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 YIL177CYIL177C 5277 nt8.31□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 EAF3YPR023C 1206 nt8.31□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 LEU4YNL104C 1860 nt8.31□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 MAM3YOL060C 2121 nt8.3□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 SAM3YPL274W 1764 nt8.3□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 COG1YGL223C 1254 nt8.3□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 PRY1YJL079C 900 nt8.3□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 SNU66YOR308C 1764 nt8.28□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 PMA2YPL036W 2844 nt8.28□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 OYE2YHR179W 1203 nt8.28□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 SAC7YDR389W 1965 nt8.28□□□□□ -1.08
SSZ1P38788 ERG13YML126C 1476 nt8.27□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 HBS1YKR084C 1836 nt8.27□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 FRT1YOR324C 1809 nt8.27□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 NDE1YMR145C 1683 nt8.27□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 RPT5YOR117W 1305 nt8.27□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.26□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 LSM5YER146W 282 nt8.24□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 NPP2YEL016C 1482 nt8.24□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 YMR265CYMR265C 1386 nt8.23□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.23□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.23□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 LOT5YKL183W 921 nt8.23□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 GND1YHR183W 1470 nt8.23□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 URH1YDR400W 1023 nt8.22□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 SMM1YNR015W 1155 nt8.22□□□□□ -1.09
SSZ1P38788 YJL118WYJL118W 660 nt8.21□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 RRT8YOL048C 1029 nt8.21□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 DUS3YLR401C 2007 nt8.2□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 RAD23YEL037C 1197 nt8.2□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 TPS1YBR126C 1488 nt8.19□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 YDR467CYDR467C 327 nt8.19□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 LCP5YER127W 1074 nt8.18□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 DDI1YER143W 1287 nt8.18□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 TMA23YMR269W 636 nt8.18□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 HAP5YOR358W 729 nt8.18□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 BEM1YBR200W 1656 nt8.18□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 GGC1YDL198C 903 nt8.17□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 RPN14YGL004C 1254 nt8.17□□□□□ -1.1
SSZ1P38788 CCR4YAL021C 2514 nt8.16□□□□□ -1.1
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