Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 INH1YDL181W 258 nt7.41□□□□□ -1.22
AVT5P38176 FCY21YER060W 1587 nt7.41□□□□□ -1.22
AVT5P38176 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.4□□□□□ -1.22
AVT5P38176 GLR1YPL091W 1452 nt7.39□□□□□ -1.23
AVT5P38176 NSG2YNL156C 900 nt7.39□□□□□ -1.23
AVT5P38176 ORT1YOR130C 879 nt7.39□□□□□ -1.23
AVT5P38176 ADE16YLR028C 1776 nt7.38□□□□□ -1.23
AVT5P38176 HEM14YER014W 1620 nt7.38□□□□□ -1.23
AVT5P38176 FLR1YBR008C 1647 nt7.38□□□□□ -1.23
AVT5P38176 YPS3YLR121C 1527 nt7.37□□□□□ -1.23
AVT5P38176 HXT12YIL170W 1374 nt7.37□□□□□ -1.23
AVT5P38176 YLR111WYLR111W 333 nt7.37□□□□□ -1.23
AVT5P38176 DLD2YDL178W 1593 nt7.36□□□□□ -1.23
AVT5P38176 LAS17YOR181W 1902 nt7.36□□□□□ -1.23
AVT5P38176 YRF1-2YER190W 5046 nt7.35□□□□□ -1.23
AVT5P38176 RIB3YDR487C 627 nt7.35□□□□□ -1.23
AVT5P38176 THI6YPL214C 1623 nt7.34□□□□□ -1.23
AVT5P38176 YMR226CYMR226C 804 nt7.34□□□□□ -1.23
AVT5P38176 RIM2YBR192W 1134 nt7.34□□□□□ -1.23
AVT5P38176 GND1YHR183W 1470 nt7.34□□□□□ -1.23
AVT5P38176 BNI5YNL166C 1347 nt7.33□□□□□ -1.24
AVT5P38176 MSC1YML128C 1542 nt7.33□□□□□ -1.24
AVT5P38176 DLD3YEL071W 1491 nt7.33□□□□□ -1.24
AVT5P38176 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.33□□□□□ -1.24
AVT5P38176 YER188WYER188W 720 nt7.33□□□□□ -1.24
AVT5P38176 PFS2YNL317W 1398 nt7.33□□□□□ -1.24
AVT5P38176 LEU4YNL104C 1860 nt7.32□□□□□ -1.24
AVT5P38176 HSV2YGR223C 1347 nt7.31□□□□□ -1.24
AVT5P38176 NPP2YEL016C 1482 nt7.31□□□□□ -1.24
AVT5P38176 NUC1YJL208C 990 nt7.31□□□□□ -1.24
AVT5P38176 YLR046CYLR046C 813 nt7.31□□□□□ -1.24
AVT5P38176 RPC31YNL151C 756 nt7.31□□□□□ -1.24
AVT5P38176 FUB1YCR076C 753 nt7.3□□□□□ -1.24
AVT5P38176 TRP2YER090W 1524 nt7.3□□□□□ -1.24
AVT5P38176 AIM34YMR003W 597 nt7.29□□□□□ -1.24
AVT5P38176 SMM1YNR015W 1155 nt7.29□□□□□ -1.24
AVT5P38176 RTG2YGL252C 1767 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 CHA1YCL064C 1083 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 CSM1YCR086W 573 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 HEM13YDR044W 987 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 PRY1YJL079C 900 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 AIM1YAL046C 357 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 DPL1YDR294C 1770 nt7.28□□□□□ -1.24
AVT5P38176 OSH7YHR001W 1314 nt7.27□□□□□ -1.24
AVT5P38176 TIP1YBR067C 633 nt7.26□□□□□ -1.25
AVT5P38176 FRT1YOR324C 1809 nt7.26□□□□□ -1.25
AVT5P38176 GGC1YDL198C 903 nt7.25□□□□□ -1.25
AVT5P38176 LOT5YKL183W 921 nt7.25□□□□□ -1.25
AVT5P38176 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.25□□□□□ -1.25
AVT5P38176 YMR244WYMR244W 1068 nt7.25□□□□□ -1.25
AVT5P38176 RAS2YNL098C 969 nt7.25□□□□□ -1.25
AVT5P38176 HXT11YOL156W 1704 nt7.24□□□□□ -1.25
AVT5P38176 CAB5YDR196C 726 nt7.23□□□□□ -1.25
AVT5P38176 RPT5YOR117W 1305 nt7.23□□□□□ -1.25
AVT5P38176 SRM1YGL097W 1449 nt7.22□□□□□ -1.25
AVT5P38176 VMA11YPL234C 495 nt7.22□□□□□ -1.25
AVT5P38176 ITR2YOL103W 1830 nt7.22□□□□□ -1.25
AVT5P38176 CTF3YLR381W 2202 nt7.21□□□□□ -1.25
AVT5P38176 BEM1YBR200W 1656 nt7.21□□□□□ -1.26
AVT5P38176 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 NDE1YMR145C 1683 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ATP10YLR393W 840 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 MDH2YOL126C 1134 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 GPN2YOR262W 1044 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 GCD11YER025W 1584 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 FTH1YBR207W 1398 nt7.2□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ECM10YEL030W 1935 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 TAT2YOL020W 1779 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 SOL2YCR073W-A 948 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 SLM3YDL033C 1254 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 YDR467CYDR467C 327 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 OYE2YHR179W 1203 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 EMC3YKL207W 762 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ENT4YLL038C 744 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 SNX3YOR357C 489 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 MAS1YLR163C 1389 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT5P38176 KRR1YCL059C 951 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 VRG4YGL225W 1014 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 YJL118WYJL118W 660 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 NME1NME1 340 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ITR1YDR497C 1755 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 SAM3YPL274W 1764 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT5P38176 PMA2YPL036W 2844 nt7.17□□□□□ -1.26
AVT5P38176 YLR173WYLR173W 1827 nt7.17□□□□□ -1.26
AVT5P38176 TOP3YLR234W 1971 nt7.17□□□□□ -1.26
AVT5P38176 PRC1YMR297W 1599 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 YPI1YFR003C 468 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 RBG2YGR173W 1107 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 EAF3YPR023C 1206 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 RIB7YBR153W 735 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT5P38176 SPE4YLR146C 903 nt7.15□□□□□ -1.26
AVT5P38176 ERG6YML008C 1152 nt7.15□□□□□ -1.26
AVT5P38176 DIA4YHR011W 1341 nt7.14□□□□□ -1.27
AVT5P38176 YJL055WYJL055W 738 nt7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms