Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDC2P34741 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDC2P34741 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDC2P34741 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDC2P34741 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDC2P34741 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDC2P34741 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDC2P34741 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDC2P34741 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDC2P34741 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDC2P34741 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDC2P34741 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDC2P34741 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDC2P34741 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDC2P34741 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDC2P34741 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDC2P34741 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDC2P34741 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDC2P34741 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDC2P34741 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDC2P34741 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDC2P34741 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDC2P34741 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDC2P34741 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDC2P34741 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDC2P34741 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDC2P34741 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDC2P34741 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDC2P34741 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDC2P34741 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDC2P34741 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDC2P34741 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDC2P34741 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDC2P34741 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDC2P34741 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDC2P34741 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDC2P34741 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDC2P34741 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDC2P34741 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDC2P34741 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDC2P34741 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDC2P34741 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDC2P34741 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDC2P34741 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDC2P34741 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDC2P34741 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDC2P34741 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDC2P34741 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDC2P34741 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDC2P34741 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDC2P34741 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDC2P34741 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDC2P34741 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDC2P34741 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDC2P34741 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDC2P34741 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDC2P34741 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDC2P34741 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDC2P34741 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDC2P34741 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDC2P34741 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDC2P34741 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDC2P34741 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDC2P34741 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDC2P34741 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDC2P34741 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDC2P34741 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDC2P34741 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDC2P34741 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDC2P34741 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDC2P34741 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDC2P34741 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDC2P34741 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDC2P34741 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDC2P34741 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDC2P34741 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDC2P34741 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDC2P34741 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDC2P34741 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDC2P34741 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDC2P34741 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDC2P34741 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDC2P34741 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDC2P34741 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms