Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3AP31941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3AP31941 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3AP31941 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3AP31941 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3AP31941 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms