Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAR1AP10644 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAR1AP10644 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAR1AP10644 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAR1AP10644 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms