Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TGFB3P10600 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TGFB3P10600 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TGFB3P10600 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB3P10600 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB3P10600 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGFB3P10600 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB3P10600 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms