Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MT-ND1P03886 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND1P03886 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MT-ND1P03886 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MT-ND1P03886 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms