Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF13O43567 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF13O43567 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF13O43567 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF13O43567 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF13O43567 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF13O43567 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF13O43567 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF13O43567 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF13O43567 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF13O43567 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF13O43567 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF13O43567 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF13O43567 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF13O43567 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF13O43567 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF13O43567 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF13O43567 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF13O43567 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF13O43567 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF13O43567 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF13O43567 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF13O43567 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF13O43567 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF13O43567 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF13O43567 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF13O43567 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF13O43567 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF13O43567 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF13O43567 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF13O43567 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF13O43567 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF13O43567 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF13O43567 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF13O43567 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF13O43567 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF13O43567 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF13O43567 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF13O43567 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF13O43567 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF13O43567 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF13O43567 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF13O43567 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF13O43567 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF13O43567 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF13O43567 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF13O43567 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF13O43567 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF13O43567 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF13O43567 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF13O43567 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF13O43567 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF13O43567 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF13O43567 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF13O43567 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF13O43567 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF13O43567 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF13O43567 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF13O43567 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF13O43567 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF13O43567 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF13O43567 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF13O43567 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF13O43567 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF13O43567 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF13O43567 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF13O43567 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF13O43567 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF13O43567 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF13O43567 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF13O43567 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF13O43567 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF13O43567 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF13O43567 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF13O43567 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF13O43567 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF13O43567 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF13O43567 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF13O43567 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF13O43567 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF13O43567 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF13O43567 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF13O43567 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF13O43567 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF13O43567 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF13O43567 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF13O43567 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF13O43567 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms