Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK2O43353 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK2O43353 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK2O43353 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK2O43353 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK2O43353 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK2O43353 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK2O43353 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK2O43353 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK2O43353 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK2O43353 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms