Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF878C9JN71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF878C9JN71 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF878C9JN71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF878C9JN71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF878C9JN71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms