Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPARGC1BQ86YN6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARGC1BQ86YN6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms