Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHA9Q7RTU4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHA9Q7RTU4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms