Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3C1V9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3C1V9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3C1V9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3C1V9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3C1V9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3C1V9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3C1V9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3C1V9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3C1V9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3C1V9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms