RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
Length
283 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
YMR320W
YMR320W
306 nt
2.27
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YNL122C
YNL122C
348 nt
2.27
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YPL197C
YPL197C
414 nt
2.27
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
SSY1
YDR160W
2559 nt
2.27
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
PRK1
YIL095W
2433 nt
2.27
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YKR078W
YKR078W
1758 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
MRP10
YDL045W-A
288 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YFR056C
YFR056C
369 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YAP3
YHL009C
993 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
MBB1
YJL199C
327 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YOR105W
YOR105W
327 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YBR277C
YBR277C
402 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
GIN4
YDR507C
3429 nt
2.26
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
TRS130
YMR218C
3309 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
RGL1
YPL066W
1440 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YHR078W
YHR078W
1659 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
RRP12
YPL012W
3687 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
RPL16A
YIL133C
600 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
RPL40A
YIL148W
387 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YLR456W
YLR456W
615 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
RPS7B
YNL096C
573 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
RPS12
YOR369C
432 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
UBP11
YKR098C
2154 nt
2.25
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YPK1
YKL126W
2043 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YGR045C
YGR045C
363 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
CCW14
YLR390W-A
717 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
ICY1
YMR195W
384 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
MRPL44
YMR225C
297 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
GPI15
YNL038W
690 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
GAL7
YBR018C
1101 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YPL150W
YPL150W
2706 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
GIS1
YDR096W
2685 nt
2.24
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
PTC5
YOR090C
1719 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
NUP100
YKL068W
2880 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
CAJ1
YER048C
1176 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
TIM8
YJR135W-A
264 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YJR140W-A
YJR140W-A
150 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
SHE2
YKL130C
741 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
LCL2
YLR104W
396 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
PBI2
YNL015W
228 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
ATP15
YPL271W
189 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
IRC16
YPR038W
360 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
JID1
YPR061C
906 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
BNI1
YNL271C
5862 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
REV1
YOR346W
2958 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YJL070C
YJL070C
2667 nt
2.23
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
TOF1
YNL273W
3717 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
ARP8
YOR141C
2646 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
FMP16
YDR070C
282 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
SMB1
YER029C
591 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YGL014C-A
YGL014C-A
162 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YPS5
YGL259W
498 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
PET191
YJR034W
327 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YKL068W-A
YKL068W-A
237 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
YKL165C-A
YKL165C-A
234 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
AIM32
YML050W
936 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
PKR1
YMR123W
369 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
OSW7
YFR039C
1533 nt
2.22
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
NCL1
YBL024W
2055 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
HAA1
YPR008W
2085 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YRB1
YDR002W
606 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YEL018C-A
YEL018C-A
534 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
MXR1
YER042W
555 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YER079C-A
YER079C-A
339 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YHR130C
YHR130C
336 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YHR214C-C
YHR214C-C
1437 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
MSL5
YLR116W
1431 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
NOP15
YNL110C
663 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
ATP19
YOL077W-A
207 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
DGK1
YOR311C
873 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YDR186C
YDR186C
2634 nt
2.21
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
VPS13
YLL040C
9435 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YDL025W-A
YDL025W-A
105 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
BNA7
YDR428C
786 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
BIG1
YHR101C
1008 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YHR180W-A
YHR180W-A
183 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YKL066W
YKL066W
444 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
PAU8
YAL068C
363 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
FYV7
YLR068W
456 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YLR379W
YLR379W
375 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
CTK3
YML112W
891 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
LSM7
YNL147W
348 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
PAU20
YOL161C
363 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
ATX2
YOR079C
942 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
PET123
YOR158W
957 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
CSF1
YLR087C
8877 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
JIP5
YPR169W
1479 nt
2.2
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
SPF1
YEL031W
3648 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
RRP6
YOR001W
2202 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
VPS64
YDR200C
1815 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
NAN1
YPL126W
2691 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
SPE1
YKL184W
1401 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YDL068W
YDL068W
330 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
TIM9
YEL020W-A
264 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YJL127C-B
YJL127C-B
159 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YJR079W
YJR079W
330 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YKL111C
YKL111C
336 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YJL181W
YJL181W
1836 nt
2.19
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YFH1
YDL120W
525 nt
2.18
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YDR194W-A
YDR194W-A
153 nt
2.18
□□□□□ -2.06
First
Previous
59
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.3 ms