Protein–RNA interactions for Protein: Q06333

CNL1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit CNL1, yeastyeast

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNL1Q06333 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 CTK3YML112W 891 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 YOR114WYOR114W 885 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 EGD1YPL037C 474 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 GPI2YPL076W 843 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 TRM3YDL112W 4311 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 SPT14YPL175W 1359 nt0.93□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 SAC3YDR159W 3906 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 ECM25YJL201W 1800 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 NCL1YBL024W 2055 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 PLP1YDR183W 693 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 YDR199WYDR199W 366 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 YDR290WYDR290W 330 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 RPL40AYIL148W 387 nt0.92□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 AZF1YOR113W 2745 nt0.91□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 NSE4YDL105W 1209 nt0.91□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 VPS55YJR044C 423 nt0.91□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 YET1YKL065C 621 nt0.91□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 COF1YLL050C 432 nt0.91□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 ARL1YBR164C 552 nt0.91□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 TRM732YMR259C 4263 nt0.9□□□□□ -2.26
CNL1Q06333 SNA4YDL123W 423 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 RPI1YIL119C 1224 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 HSK3YKL138C-A 210 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 CSI1YMR025W 888 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 RBL2YOR265W 321 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YPR063CYPR063C 423 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SPP381YBR152W 876 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 CSH1YBR161W 1131 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 AME1YBR211C 975 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YCL007CYCL007C 393 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SSF2YDR312W 1362 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 PEX8YGR077C 1770 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 ZRG8YER033C 3231 nt0.9□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YLR422WYLR422W 5799 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 UFD2YDL190C 2886 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 VAB2YEL005C 849 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SMD1YGR074W 441 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 VOA1YGR106C 798 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 BUD19YJL188C 309 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YKE2YLR200W 345 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 LSM7YNL147W 348 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YPR142CYPR142C 564 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 LDH1YBR204C 1128 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 RRP7YCL031C 894 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 MVP1YMR004W 1536 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.89□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 BEM2YER155C 6504 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YIP1YGR172C 747 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YJL119CYJL119C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 RPN8YOR261C 1017 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 PIG2YIL045W 1617 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 DGR2YKL121W 2559 nt0.88□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 MMS22YLR320W 4365 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 MSS11YMR164C 2277 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SMC1YFL008W 3678 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 MET14YKL001C 609 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 RAM2YKL019W 951 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YET2YMR040W 483 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 ERV15YBR210W 429 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YGR250CYGR250C 2346 nt0.87□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YDR537CYDR537C 606 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 PRP38YGR075C 729 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SDL1YIL167W 633 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YNL114CYNL114C 372 nt0.86□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 DAS1YJL149W 1992 nt0.85□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YDR336WYDR336W 945 nt0.85□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.85□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YGL024WYGL024W 336 nt0.85□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SPO75YLL005C 2607 nt0.85□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 DOT6YER088C 2013 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SNF12YNR023W 1701 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SNF5YBR289W 2718 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 snR57snR57 88 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 GIC2YDR309C 1152 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 DUO1YGL061C 744 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 GIC1YHR061C 945 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YJL032WYJL032W 315 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 FAR3YMR052W 615 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 YNL226WYNL226W 411 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 ATX1YNL259C 222 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 SNC2YOR327C 348 nt0.84□□□□□ -2.27
CNL1Q06333 NUR1YDL089W 1455 nt0.84□□□□□ -2.28
CNL1Q06333 NUP188YML103C 4968 nt0.84□□□□□ -2.28
CNL1Q06333 SEF1YBL066C 3447 nt0.83□□□□□ -2.28
CNL1Q06333 CTF13YMR094W 1437 nt0.83□□□□□ -2.28
CNL1Q06333 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 120.2 ms