Protein–RNA interactions for Protein: P61129

ZC3H6, Zinc finger CCCH domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H6P61129 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H6P61129 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H6P61129 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H6P61129 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H6P61129 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H6P61129 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms