Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms