Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BHMG1C9JSJ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms