Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms