Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 FAS1YKL182W 6156 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YFL065CYFL065C 309 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 PAU14YIL176C 363 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 PAU1YJL223C 363 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 RPL8BYLL045C 771 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 SMA2YML066C 1110 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 VHR2YER064C 1518 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 BYE1YKL005C 1785 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 SMC3YJL074C 3693 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 PEX1YKL197C 3132 nt3.17□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 GPI13YLL031C 3054 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 PWP2YCR057C 2772 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 TSA2YDR453C 591 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 AIM26YKL037W 357 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 SRL3YKR091W 741 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YPR053CYPR053C 456 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 KAP95YLR347C 2586 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 VPS41YDR080W 2979 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 RDS1YCR106W 2499 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 HFM1YGL251C 3564 nt3.16□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 SEA4YBL104C 3117 nt3.15□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YDL211CYDL211C 1119 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 AST2YER101C 1293 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 PAU23YLR037C 375 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RPS8AYBL072C 603 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RPL23AYBL087C 414 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 PEX11YOL147C 711 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 SSY1YDR160W 2559 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 PDC2YDR081C 2778 nt3.15□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 MSD1YPL104W 1977 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 FLO9YAL063C 3969 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 ISD11YER048W-A 285 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RPB9YGL070C 369 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 PSY1YKL076C 384 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YOL160WYOL160W 342 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RRP5YMR229C 5190 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 REV1YOR346W 2958 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TLC1TLC1 1301 nt3.14□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 XRN1YGL173C 4587 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 SPP382YLR424W 2127 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RKM1YPL208W 1752 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RRN6YBL014C 2685 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YDR344CYDR344C 444 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 LSM1YJL124C 519 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YAR070CYAR070C 300 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YBR137WYBR137W 540 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 SWI1YPL016W 3945 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 NAN1YPL126W 2691 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 SNF12YNR023W 1701 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TCB3YML072C 4638 nt3.13□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 COX1Q0045 1605 nt3.12□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 EGD1YPL037C 474 nt3.12□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 CIN1YOR349W 3045 nt3.12□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RAD4YER162C 2265 nt3.12□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 AUS1YOR011W 4185 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TOM70YNL121C 1854 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RPN2YIL075C 2838 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YGR069WYGR069W 336 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YJL182CYJL182C 318 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TAR1YLR154W-C 375 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TMA10YLR327C 261 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YCK3YER123W 1575 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 PRK1YIL095W 2433 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 GYL1YMR192W 2163 nt3.11□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 MSS11YMR164C 2277 nt3.1□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 JEN1YKL217W 1851 nt3.1□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TMA17YDL110C 453 nt3.1□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 BMS1YPL217C 3552 nt3.1□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 ETP1YHL010C 1758 nt3.1□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 TRZ1YKR079C 2517 nt3.1□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YKR033CYKR033C 426 nt3.09□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 RPL26AYLR344W 384 nt3.09□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 YNR042WYNR042W 429 nt3.09□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 LEU3YLR451W 2661 nt3.09□□□□□ -1.91
TRM13Q12383 PKH1YDR490C 2301 nt3.09□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 YEL025CYEL025C 3567 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 FRT2YAL028W 1587 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 YDL011CYDL011C 324 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 DAD4YDR320C-A 219 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 MZM1YDR493W 372 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 TIM8YJR135W-A 264 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 RPS22BYLR367W 393 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 GIS2YNL255C 462 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 RFC3YNL290W 1023 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 DAD3YBR233W-A 285 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 snR49snR49 165 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 YJL016WYJL016W 1686 nt3.08□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 GCN1YGL195W 8019 nt3.07□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 PDR12YPL058C 4536 nt3.07□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 YGR151CYGR151C 336 nt3.07□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 GPI14YJR013W 1212 nt3.07□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 TMA19YKL056C 504 nt3.07□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 HSK3YKL138C-A 210 nt3.07□□□□□ -1.92
TRM13Q12383 YLR458WYLR458W 381 nt3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97.3 ms