Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 TFC4YGR047C 3078 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 MMS1YPR164W 4224 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 SPC1YJR010C-A 285 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 CMS1YLR003C 876 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 MRPL33YMR286W 261 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 PFF1YBR074W 2931 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 YIL169CYIL169C 2988 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 YCR001WYCR001W 315 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 ERP6YGL002W 651 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 PBI2YNL015W 228 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 GPI15YNL038W 690 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 ATX2YOR079C 942 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 YIL080WYIL080W 4722 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 SDC25YLL016W 3147 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 ECM29YHL030W 5607 nt2.57□□□□□ -2
SEF1P34228 RLI1YDR091C 1827 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 YBT1YLL048C 4986 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 YHR130CYHR130C 336 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 CCW14YLR390W-A 717 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 MSB2YGR014W 3921 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 ECM5YMR176W 4236 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 SEC7YDR170C 6030 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 CAF120YNL278W 3183 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 CDC20YGL116W 1833 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 PSO2YMR137C 1986 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 DPB11YJL090C 2295 nt2.56□□□□□ -2
SEF1P34228 ASM4YDL088C 1587 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 VAR1Q0140 1197 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 COX13YGL191W 390 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 TPM2YIL138C 486 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 PEP8YJL053W 1140 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 ECM25YJL201W 1800 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 RPS1AYLR441C 768 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 RPB11YOL005C 363 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 CRS5YOR031W 210 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 snR43snR43 209 nt2.55□□□□□ -2
SEF1P34228 UTP13YLR222C 2454 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 RGA2YDR379W 3030 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 YLR001CYLR001C 2589 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 RVS161YCR009C 798 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 YJR023CYJR023C 402 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 YLR297WYLR297W 390 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 YML037CYML037C 1023 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 CTK3YML112W 891 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 TRM7YBR061C 933 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 IRC16YPR038W 360 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 CYR1YJL005W 6081 nt2.54□□□□□ -2
SEF1P34228 NDD1YOR372C 1665 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 SSE1YPL106C 2082 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 BNA7YDR428C 786 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 IRC4YDR540C 540 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 YJL007CYJL007C 315 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 RPL36AYMR194W 303 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 YPL039WYPL039W 951 nt2.53□□□□□ -2
SEF1P34228 TOP2YNL088W 4287 nt2.53□□□□□ -2.01
SEF1P34228 ISW1YBR245C 3390 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 MDM32YOR147W 1869 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 LEU3YLR451W 2661 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RNR4YGR180C 1038 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YIL058WYIL058W 285 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RNP1YLL046C 750 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RPL33AYPL143W 324 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 PSK2YOL045W 3306 nt2.52□□□□□ -2.01
SEF1P34228 AMS1YGL156W 3252 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 ASG1YIL130W 2895 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 GPI8YDR331W 1236 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RRT13YER066W 558 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YGL165CYGL165C 579 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 BIG1YHR101C 1008 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 HYR1YIR037W 492 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 SYM1YLR251W 594 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YLR379WYLR379W 375 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YOR385WYOR385W 873 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 BAS1YKR099W 2436 nt2.51□□□□□ -2.01
SEF1P34228 ROY1YMR258C 1662 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 ATP6Q0085 780 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YJL202CYJL202C 348 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 VPH2YKL119C 648 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YLR171WYLR171W 390 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 PKR1YMR123W 369 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 URA10YMR271C 684 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 RUF22RUF22 515 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 SPC29YPL124W 762 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YPL197CYPL197C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 YBR197CYBR197C 654 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 ESC1YMR219W 4977 nt2.5□□□□□ -2.01
SEF1P34228 VPS41YDR080W 2979 nt2.5□□□□□ -2.01
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