Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms