Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms