Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INPP4AQ96PE3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INPP4AQ96PE3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms