Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC82Q8N4S0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms