Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
WDR53Q7Z5U6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms