Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YPT6YLR262C 648 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 PAI3YMR174C 207 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YNL046WYNL046W 519 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 CRS5YOR031W 210 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 CDC37YDR168W 1521 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 PEP12YOR036W 867 nt2.09□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 ARF3YOR094W 552 nt2.09□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 MSS18YPR134W 807 nt2.09□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 ADF1YCL058W-A 342 nt2.09□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 CBF2YGR140W 2871 nt2.09□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 AFI1YOR129C 2682 nt2.09□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 GPI17YDR434W 1605 nt2.09□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 SIP3YNL257C 3690 nt2.09□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 ALK2YBL009W 2031 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 DNF1YER166W 4716 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 BRE1YDL074C 2103 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YNL018CYNL018C 1839 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 TIF35YDR429C 825 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 CAP1YKL007W 807 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RPS22BYLR367W 393 nt2.08□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PUT3YKL015W 2940 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 KSP1YHR082C 3090 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YIL166CYIL166C 1629 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RPS24AYER074W 408 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 ATP7YKL016C 525 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 UBC12YLR306W 567 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YNR021WYNR021W 1215 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YOR283WYOR283W 693 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 ARR2YPR200C 393 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 MCD1YDL003W 1701 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YKL075CYKL075C 1353 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 HOS4YIL112W 3252 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 Q0255Q0255 1419 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RGL1YPL066W 1440 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 IRC8YJL051W 2469 nt2.07□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 HSC82YMR186W 2118 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 ROY1YMR258C 1662 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YCR108CYCR108C 192 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 ACB1YGR037C 264 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 SEC28YIL076W 891 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 VPS63YLR261C 327 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YMR320WYMR320W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 MIX23YBL107C 591 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 POP7YBR167C 423 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 KOG1YHR186C 4674 nt2.06□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YER189WYER189W 369 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 TWF1YGR080W 999 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YGR242WYGR242W 309 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 LIN1YHR156C 1023 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PAU8YAL068C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RPS16AYMR143W 432 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PAU20YOL161C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 GRX5YPL059W 453 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 URK1YNR012W 1506 nt2.05□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RPS17BYDR447C 411 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RPS26BYER131W 360 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 TAD1YGL243W 1203 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PRP38YGR075C 729 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YJL086CYJL086C 369 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 ELG1YOR144C 2376 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YOR169CYOR169C 465 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YBR287WYBR287W 1284 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 FKS1YLR342W 5631 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PRP6YBR055C 2700 nt2.04□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YRR1YOR162C 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 NPR1YNL183C 2373 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 SNF12YNR023W 1701 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 NCS2YNL119W 1482 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 BRP1YGL007W 378 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RPC25YKL144C 639 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PRK1YIL095W 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 YPR097WYPR097W 3222 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 RGA1YOR127W 3024 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 PSO2YMR137C 1986 nt2.03□□□□□ -2.08
RRP42Q12277 SDC1YDR469W 528 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YGR115CYGR115C 780 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 UTP30YKR060W 825 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 DGR1YNL130C-A 147 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 SWM2YNR004W 441 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 SFM1YOR021C 642 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 SRL4YPL033C 846 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 TRM7YBR061C 933 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 NOP14YDL148C 2433 nt2.02□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 snR83snR83 306 nt2.01□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YGL109WYGL109W 324 nt2.01□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 AIM19YIL087C 474 nt2.01□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 RIO2YNL207W 1278 nt2.01□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 VID24YBR105C 1089 nt2.01□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 USO1YDL058W 5373 nt2.01□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 TOR2YKL203C 7425 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 DAD1YDR016C 285 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 RPL27BYDR471W 411 nt2□□□□□ -2.09
RRP42Q12277 YIP1YGR172C 747 nt2□□□□□ -2.09
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