Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt6.85□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 YPR092WYPR092W 306 nt6.85□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 JJJ2YJL162C 1752 nt6.85□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 VID30YGL227W 2877 nt6.84□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 YRA1YDR381W 681 nt6.84□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 CWC21YDR482C 408 nt6.84□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 YJR085CYJR085C 318 nt6.84□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 YPL062WYPL062W 405 nt6.84□□□□□ -1.31
DIP2Q12220 OCA5YHL029C 2040 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 YEL045CYEL045C 426 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 LSM7YNL147W 348 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 SNC2YOR327C 348 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 PYC2YBR218C 3543 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 TFB1YDR311W 1929 nt6.83□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 PDC2YDR081C 2778 nt6.82□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 CDC24YAL041W 2565 nt6.82□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 SEA4YBL104C 3117 nt6.81□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt6.81□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 FRE3YOR381W 2136 nt6.81□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 KIP2YPL155C 2121 nt6.81□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 ASG1YIL130W 2895 nt6.8□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 YFR035CYFR035C 345 nt6.8□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 DBF4YDR052C 2115 nt6.79□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 PUF6YDR496C 1971 nt6.79□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 ULI1YFR026C 510 nt6.79□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 EMP24YGL200C 612 nt6.79□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 ECM16YMR128W 3804 nt6.79□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 RED1YLR263W 2484 nt6.79□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 UPC2YDR213W 2742 nt6.78□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.78□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 YIL059CYIL059C 366 nt6.78□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 SYG1YIL047C 2709 nt6.78□□□□□ -1.32
DIP2Q12220 MRC1YCL061C 3291 nt6.77□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 UPS1YLR193C 528 nt6.77□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 AMD1YML035C 2433 nt6.77□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 RPS27AYKL156W 249 nt6.76□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 SEC9YGR009C 1956 nt6.76□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 NUP82YJL061W 2142 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 ARK1YNL020C 1917 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 CDC27YBL084C 2277 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 APC4YDR118W 1959 nt6.75□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 PRP43YGL120C 2304 nt6.74□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 ASK10YGR097W 3441 nt6.73□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 YPR053CYPR053C 456 nt6.73□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 HIR2YOR038C 2628 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 FAA2YER015W 2235 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 MCM3YEL032W 2916 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 NDC1YML031W 1968 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 snR79snR79 84 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 PIG1YLR273C 1947 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 PTA1YAL043C 2358 nt6.72□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 DIS3YOL021C 3006 nt6.71□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 YDR109CYDR109C 2148 nt6.71□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 TCP1YDR212W 1680 nt6.71□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 YPK1YKL126W 2043 nt6.71□□□□□ -1.33
DIP2Q12220 YOR318CYOR318C 306 nt6.71□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 GUP1YGL084C 1683 nt6.71□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 BBC1YJL020C 3474 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 MPS1YDL028C 2295 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 SRP72YPL210C 1923 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 COX9YDL067C 180 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YDR286CYDR286C 345 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 POG1YIL122W 1056 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 ASC1YMR116C 960 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 RPL33BYOR234C 324 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 PXA1YPL147W 2613 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 SHE10YGL228W 1734 nt6.7□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 SSQ1YLR369W 1974 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 RBK1YCR036W 1002 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 snR74snR74 88 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YJL022WYJL022W 309 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 COX5AYNL052W 462 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 RPL23AYBL087C 414 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YPR146CYPR146C 330 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 APC2YLR127C 2562 nt6.69□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 SSS1YDR086C 243 nt6.68□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 TRX1YLR043C 312 nt6.68□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 SPO21YOL091W 1830 nt6.68□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 VPS54YDR027C 2670 nt6.67□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YOL057WYOL057W 2136 nt6.67□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YML007C-AYML007C-A 111 nt6.67□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 ROD1YOR018W 2514 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 PMP1YCR024C-A 123 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YER121WYER121W 345 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YIL058WYIL058W 285 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YLR255CYLR255C 354 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 FUN12YAL035W 3009 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 YRM1YOR172W 2361 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 CWH43YCR017C 2862 nt6.66□□□□□ -1.34
DIP2Q12220 ERP6YGL002W 651 nt6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.2 ms