Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.8□□□□□ -2.28
DIP2Q12220 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.78□□□□□ -2.28
DIP2Q12220 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.73□□□□□ -2.29
DIP2Q12220 snR161snR161 161 nt0.69□□□□□ -2.3
DIP2Q12220 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.68□□□□□ -2.3
DIP2Q12220 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.66□□□□□ -2.3
DIP2Q12220 snR6snR6 112 nt0.61□□□□□ -2.31
DIP2Q12220 snR58snR58 96 nt0.45□□□□□ -2.34
DIP2Q12220 snR73snR73 106 nt0.3□□□□□ -2.36
DIP2Q12220 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.04□□□□□ -2.4
DIP2Q12220 URB1YKL014C 5295 nt0.01□□□□□ -2.41
DIP2Q12220 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.09□□□□□ -2.42
DIP2Q12220 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.12□□□□□ -2.43
DIP2Q12220 YOR309CYOR309C 381 nt-0.35□□□□□ -2.47
DIP2Q12220 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.36□□□□□ -2.47
DIP2Q12220 snR33snR33 183 nt-0.42□□□□□ -2.48
DIP2Q12220 snR87snR87 109 nt-0.51□□□□□ -2.49
DIP2Q12220 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
DIP2Q12220 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
DIP2Q12220 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
DIP2Q12220 YNR077CYNR077C 255 nt-0.74□□□□□ -2.53
DIP2Q12220 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.8□□□□□ -2.54
DIP2Q12220 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.1□□□□□ -2.59
DIP2Q12220 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.5□□□□□ -2.65
DIP2Q12220 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.92□□□□□ -2.72
DIP2Q12220 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.47□□□□□ -2.8
DIP2Q12220 YDR543CYDR543C 300 nt-2.52□□□□□ -2.81
DIP2Q12220 YJR162CYJR162C 351 nt-3.09□□□□□ -2.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.6 ms