Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 SET2YJL168C 2202 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 KOG1YHR186C 4674 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 VAC8YEL013W 1737 nt1.89□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 PRP38YGR075C 729 nt1.89□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 BTN2YGR142W 1233 nt1.89□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 TPK3YKL166C 1197 nt1.89□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 HYM1YKL189W 1200 nt1.89□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 CTF13YMR094W 1437 nt1.89□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 REV3YPL167C 4515 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 LST4YKL176C 2487 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 GCN4YEL009C 846 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 VPS8YAL002W 3825 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 TMA7YLR262C-A 195 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 SRL4YPL033C 846 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 IPT1YDR072C 1584 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RUD3YOR216C 1455 nt1.88□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 UBR2YLR024C 5619 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 PUT3YKL015W 2940 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 SPT14YPL175W 1359 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 UTP21YLR409C 2820 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 CDC60YPL160W 3273 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 NSE4YDL105W 1209 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 THG1YGR024C 714 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 COX8YLR395C 237 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 ALK2YBL009W 2031 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RTP1YMR185W 2946 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 VID24YBR105C 1089 nt1.87□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 TRL1YJL087C 2484 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RPS26BYER131W 360 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 CUP1-1YHR053C 186 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 CUP1-2YHR055C 186 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 GIM5YML094W 492 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 MTG1YMR097C 1104 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 END3YNL084C 1050 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RAD18YCR066W 1464 nt1.86□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 MET18YIL128W 3099 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RTT107YHR154W 3213 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 UBC5YDR059C 447 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 COX13YGL191W 390 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YHR210CYHR210C 1026 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 CAP1YKL007W 807 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 PAI3YMR174C 207 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 SFM1YOR021C 642 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YBR051WYBR051W 351 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 ARL1YBR164C 552 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 UBS1YBR165W 834 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 NIC96YFR002W 2520 nt1.85□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 LEU3YLR451W 2661 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 ECM5YMR176W 4236 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 PDR8YLR266C 2106 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 MGA2YIR033W 3342 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 FMP16YDR070C 282 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YFR056CYFR056C 369 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 MPC1YGL080W 393 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 SHE2YKL130C 741 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 MED8YBR193C 672 nt1.84□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 ATG9YDL149W 2994 nt1.84□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 BUB1YGR188C 3066 nt1.84□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 SHS1YDL225W 1656 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 SNF12YNR023W 1701 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 ECM25YJL201W 1800 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 NCB2YDR397C 441 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 LSM12YHR121W 564 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YIL058WYIL058W 285 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 POL32YJR043C 1053 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 ATG38YLR211C 681 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 GPN3YLR243W 819 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 STD1YOR047C 1335 nt1.83□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 APL5YPL195W 2799 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 DFG16YOR030W 1860 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 RMD6YEL072W 696 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YGL218WYGL218W 651 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 PSY1YKL076C 384 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 RLP24YLR009W 600 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YIP3YNL044W 531 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 GIM3YNL153C 390 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 NSL1YPL233W 651 nt1.82□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 HER1YOR227W 3741 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 RNH70YGR276C 1662 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 UBP11YKR098C 2154 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 HTB1YDR224C 396 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 GPI8YDR331W 1236 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YHR022CYHR022C 771 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 RPS16AYMR143W 432 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 MGE1YOR232W 687 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 YNL034WYNL034W 1839 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 ASG1YIL130W 2895 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 GDI1YER136W 1356 nt1.81□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 BUD2YKL092C 3315 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 STE2YFL026W 1296 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 PAU14YIL176C 363 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 AIM23YJL131C 1071 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 PAU1YJL223C 363 nt1.8□□□□□ -2.12
MSH5Q12175 snR43snR43 209 nt1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.4 ms