Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 PSD2YGR170W 3417 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 AFR1YDR085C 1863 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 NTF2YER009W 378 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 FAR7YFR008W 666 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RPL14BYHL001W 417 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SPO13YHR014W 876 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RPS1AYLR441C 768 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 ATP18YML081C-A 180 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RRT16YNL105W 429 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 snR191snR191 274 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 snR43snR43 209 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SLH1YGR271W 5904 nt2.74□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YJL132WYJL132W 2253 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 NCS2YNL119W 1482 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YFH1YDL120W 525 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SNA4YDL123W 423 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 TDA2YER071C 381 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RPL25YOL127W 429 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 PRM3YPL192C 402 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YEL1YBL060W 2064 nt2.73□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 GIN4YDR507C 3429 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SEC26YDR238C 2922 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SEC7YDR170C 6030 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RPN3YER021W 1572 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YGR228WYGR228W 345 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YIL174WYIL174W 228 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RPS22AYJL190C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SYM1YLR251W 594 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YLR252WYLR252W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 VPS63YLR261C 327 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 CCW14YLR390W-A 717 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YMR144WYMR144W 1029 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 EDS1YBR033W 2760 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YGR067CYGR067C 2415 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 TRM2YKR056W 1920 nt2.72□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SSP1YHR184W 1716 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 ASM4YDL088C 1587 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 DNA2YHR164C 4569 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 SPB1YCL054W 2526 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 CDC20YGL116W 1833 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 GIM4YEL003W 336 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 EAF6YJR082C 342 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 ACF4YJR083C 930 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 MRP49YKL167C 414 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 HEM4YOR278W 828 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YBR051WYBR051W 351 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 AMS1YGL156W 3252 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 SLN1YIL147C 3663 nt2.71□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 APC2YLR127C 2562 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 SHS1YDL225W 1656 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 PCK1YKR097W 1650 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 GCD10YNL062C 1437 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YMR31YFR049W 372 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YJL007CYJL007C 315 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 CWC24YLR323C 780 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 ATX2YOR079C 942 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YOR169CYOR169C 465 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 ATP3YBR039W 936 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 RSA1YPL193W 1146 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YBR062CYBR062C 543 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YPL261CYPL261C 309 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YKL075CYKL075C 1353 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 GDS1YOR355W 1569 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.7□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 GAL80YML051W 1308 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 CYR1YJL005W 6081 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 CBS1YDL069C 690 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YRB1YDR002W 606 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 COX13YGL191W 390 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 LRP1YHR081W 555 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YIR020CYIR020C 303 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YAL037WYAL037W 804 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YDR186CYDR186C 2634 nt2.69□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 AXL1YPR122W 3627 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 TIM10YHR005C-A 282 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 CSE4YKL049C 690 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YLR334CYLR334C 381 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 PDP3YLR455W 915 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 SAS2YMR127C 1017 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 SAC3YDR159W 3906 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 RPO41YFL036W 4056 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 FUS1YCL027W 1539 nt2.68□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 ALY1YKR021W 2748 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YBT1YLL048C 4986 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 snR59snR59 78 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YNL046WYNL046W 519 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 YNL150WYNL150W 408 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 PHO80YOL001W 882 nt2.67□□□□□ -1.98
HEL2Q05580 CRS5YOR031W 210 nt2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.5 ms