Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB1P53618 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPB1P53618 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPB1P53618 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB1P53618 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB1P53618 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB1P53618 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB1P53618 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB1P53618 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB1P53618 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms