Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 GET1YGL020C 708 nt2.91□□□□□ -1.94
LRE1P25579 RTS3YGR161C 792 nt2.91□□□□□ -1.94
LRE1P25579 HSP10YOR020C 321 nt2.91□□□□□ -1.94
LRE1P25579 SPO23YBR250W 1572 nt2.91□□□□□ -1.94
LRE1P25579 SNF12YNR023W 1701 nt2.9□□□□□ -1.94
LRE1P25579 YKR078WYKR078W 1758 nt2.9□□□□□ -1.94
LRE1P25579 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.9□□□□□ -1.95
LRE1P25579 RAD6YGL058W 519 nt2.9□□□□□ -1.95
LRE1P25579 SEN15YMR059W 387 nt2.9□□□□□ -1.95
LRE1P25579 BUD21YOR078W 645 nt2.9□□□□□ -1.95
LRE1P25579 CDH1YGL003C 1701 nt2.9□□□□□ -1.95
LRE1P25579 CWC22YGR278W 1734 nt2.9□□□□□ -1.95
LRE1P25579 DRS2YAL026C 4068 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 PPN1YDR452W 2025 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 ERG28YER044C 447 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 AGA2YGL032C 264 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 HUR1YGL168W 333 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 CDC55YGL190C 1581 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 ERV1YGR029W 570 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YOR385WYOR385W 873 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPL080CYPL080C 327 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 snR54snR54 86 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR001CYLR001C 2589 nt2.89□□□□□ -1.95
LRE1P25579 PFK26YIL107C 2484 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 UTP13YLR222C 2454 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 MOT1YPL082C 5604 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 SPE1YKL184W 1401 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 RPL29YFR032C-A 180 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 BAT1YHR208W 1182 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 BET3YKR068C 582 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YMR141CYMR141C 309 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 TFC1YBR123C 1950 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 ECM29YHL030W 5607 nt2.88□□□□□ -1.95
LRE1P25579 RAX2YLR084C 3663 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 SIP3YNL257C 3690 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 AI2Q0055 2565 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 SMB1YER029C 591 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPS5YGL259W 498 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 TCD1YHR003C 1290 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 TIF11YMR260C 462 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPL039WYPL039W 951 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPR012WYPR012W 255 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 DUF1YOL087C 3351 nt2.87□□□□□ -1.95
LRE1P25579 VPS64YDR200C 1815 nt2.86□□□□□ -1.95
LRE1P25579 RNR4YGR180C 1038 nt2.86□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR101CYLR101C 396 nt2.86□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YNL046WYNL046W 519 nt2.86□□□□□ -1.95
LRE1P25579 PEP12YOR036W 867 nt2.86□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPL276WYPL276W 438 nt2.86□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YER138CYER138C 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YER160CYER160C 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YJR027WYJR027W 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YML039WYML039W 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YML045WYML045W 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YMR050CYMR050C 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 RRT13YER066W 558 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 DLS1YJL065C 504 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 VPH2YKL119C 648 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YKR033CYKR033C 426 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 RMP1YLR145W 606 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YLR334CYLR334C 381 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YAK1YJL141C 2424 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 FAR1YJL157C 2493 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 GYP7YDL234C 2241 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YHR078WYHR078W 1659 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 NPR1YNL183C 2373 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 SEN54YPL083C 1404 nt2.85□□□□□ -1.95
LRE1P25579 SMC2YFR031C 3513 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 VAS1YGR094W 3315 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YCR064CYCR064C 411 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 TIF35YDR429C 825 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.1 ms