Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE2O96020 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms