Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD21O60216 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD21O60216 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms