Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC93Q567U6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC93Q567U6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms