Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIF1AQ16665 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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